Erik Morell Salqvist blev matchhjälte med sitt avgörande 2-1-mål efter 59 minuter.
Katrineholms SK U gjorde första målet. Ibrahim Alalloush gjorde målet, redan i tionde minuten.
FC Nyköping kvitterade till 1-1 i tolfte minuten. Med en dryg halvtimme kvar att spela nätade Erik Morell Salqvist och avgjorde matchen. Morell Salqvist fullbordade därmed FC Nyköpings vändning.
Det här var Katrineholms SK U:s andra uddamålsförlust den här säsongen.
Resultatet betyder att båda lagen har oförändrad position i tabellen, Katrineholms SK U på sjunde plats och FC Nyköping i serieledning.
Nästa motstånd för Katrineholms SK U är Gnesta. Lagen möts lördag 28 juni 13.00 på Hagstumosse IP.