31-åringen startade i onsdagens Svenska cupen-möte med Dalkurd (3–0), men tvingades kliva av med en lindad vad.
Samma vadskada stoppar nu Guidetti från spel ett tag framöver. Enligt AIK väntar "en längre rehab" för Guidetti innan han är tillbaka i spel.
"Det är ett hårt slag för AIK och för klubbens supportrar, men ett ännu större slag för John själv. John har jobbat hårt för att komma i toppform, och nu måste vi ge honom det stöd och den uppbackning som han behöver för att komma tillbaka starkt", säger AIK:s sportchef Thomas Berntsen.
John Guidetti har, precis som sitt klubblag, haft en tung säsong. Anfallsstjärnan har endast gjort ett mål på 14 matchen i serien och fått börja på bänken i tre av de fyra senaste allsvenska matcherna.
AIK ligger på 14:e plats, vilket innebär kval, i allsvenskan.