Efteråt firade ett par spelare i laget framgången med sina supportrar på parkeringen utanför arenan.
Klubben straffas nu med böter av den tyska fotbollsligan, DFL.
Det improviserade partyt bryter mot ligans regelverk kring coronaviruset. DFL upptäckte överträdelsen efter att ha tagit del av bilder från sociala medier där bland annat Union Berlins tränare, Urs Fischer, samt lagkaptenen Christopher Trimmel och mittfältaren Sheraldo Becker firar närgånget med supportrar.
"De har uppenbart brutit mot de allmänna hygien- och skyddsbestämmelserna som råder", skriver ligan i ett uttalande.
Både Trimmel och Becker tvingas nu till isolering fram till att de testats negativt för covid-19.
I klubben spelar även den svenska landslagsanfallaren Sebastian Andersson.